Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LTBQ06643 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LTBQ06643 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LTBQ06643 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBQ06643 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBQ06643 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LTBQ06643 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LTBQ06643 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBQ06643 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBQ06643 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBQ06643 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBQ06643 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBQ06643 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBQ06643 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBQ06643 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LTBQ06643 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBQ06643 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBQ06643 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBQ06643 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LTBQ06643 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBQ06643 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBQ06643 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBQ06643 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBQ06643 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBQ06643 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTBQ06643 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBQ06643 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTBQ06643 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBQ06643 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTBQ06643 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBQ06643 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBQ06643 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBQ06643 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBQ06643 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTBQ06643 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBQ06643 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LTBQ06643 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBQ06643 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LTBQ06643 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBQ06643 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBQ06643 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBQ06643 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTBQ06643 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBQ06643 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBQ06643 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LTBQ06643 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBQ06643 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LTBQ06643 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBQ06643 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBQ06643 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LTBQ06643 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LTBQ06643 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LTBQ06643 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBQ06643 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBQ06643 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBQ06643 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTBQ06643 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBQ06643 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBQ06643 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTBQ06643 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LTBQ06643 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBQ06643 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBQ06643 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBQ06643 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBQ06643 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBQ06643 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBQ06643 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBQ06643 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBQ06643 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBQ06643 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBQ06643 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBQ06643 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBQ06643 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBQ06643 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBQ06643 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBQ06643 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBQ06643 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBQ06643 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBQ06643 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBQ06643 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBQ06643 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBQ06643 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBQ06643 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBQ06643 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBQ06643 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBQ06643 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBQ06643 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBQ06643 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBQ06643 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBQ06643 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBQ06643 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBQ06643 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBQ06643 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBQ06643 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBQ06643 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBQ06643 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBQ06643 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBQ06643 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTBQ06643 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LTBQ06643 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms