Protein–RNA interactions for Protein: P78382

SLC35A1, CMP-sialic acid transporter, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A1P78382 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC35A1P78382 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC35A1P78382 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35A1P78382 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC35A1P78382 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC35A1P78382 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms