Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRTAP10-9P60411 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP10-9P60411 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-9P60411 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP10-9P60411 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRTAP10-9P60411 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP10-9P60411 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms