Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOSBP53539 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOSBP53539 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOSBP53539 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOSBP53539 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
FOSBP53539 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOSBP53539 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOSBP53539 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOSBP53539 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
FOSBP53539 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOSBP53539 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOSBP53539 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FOSBP53539 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOSBP53539 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOSBP53539 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOSBP53539 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOSBP53539 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOSBP53539 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOSBP53539 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOSBP53539 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOSBP53539 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOSBP53539 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOSBP53539 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOSBP53539 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOSBP53539 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOSBP53539 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOSBP53539 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOSBP53539 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOSBP53539 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOSBP53539 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOSBP53539 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOSBP53539 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOSBP53539 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOSBP53539 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOSBP53539 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOSBP53539 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOSBP53539 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOSBP53539 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
FOSBP53539 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOSBP53539 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOSBP53539 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOSBP53539 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOSBP53539 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOSBP53539 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOSBP53539 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOSBP53539 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOSBP53539 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOSBP53539 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FOSBP53539 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FOSBP53539 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOSBP53539 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOSBP53539 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOSBP53539 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOSBP53539 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOSBP53539 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FOSBP53539 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOSBP53539 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
FOSBP53539 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOSBP53539 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOSBP53539 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOSBP53539 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
FOSBP53539 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOSBP53539 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOSBP53539 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOSBP53539 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOSBP53539 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FOSBP53539 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOSBP53539 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOSBP53539 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOSBP53539 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FOSBP53539 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOSBP53539 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FOSBP53539 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOSBP53539 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOSBP53539 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOSBP53539 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOSBP53539 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOSBP53539 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOSBP53539 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FOSBP53539 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOSBP53539 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOSBP53539 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOSBP53539 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOSBP53539 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOSBP53539 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
FOSBP53539 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOSBP53539 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOSBP53539 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOSBP53539 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOSBP53539 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FOSBP53539 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOSBP53539 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOSBP53539 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FOSBP53539 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOSBP53539 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOSBP53539 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOSBP53539 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FOSBP53539 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FOSBP53539 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FOSBP53539 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms