Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BMI1P35226 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BMI1P35226 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BMI1P35226 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BMI1P35226 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMI1P35226 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMI1P35226 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMI1P35226 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMI1P35226 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMI1P35226 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BMI1P35226 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BMI1P35226 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BMI1P35226 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BMI1P35226 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMI1P35226 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMI1P35226 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BMI1P35226 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMI1P35226 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BMI1P35226 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMI1P35226 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMI1P35226 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BMI1P35226 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BMI1P35226 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMI1P35226 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMI1P35226 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMI1P35226 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMI1P35226 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMI1P35226 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMI1P35226 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BMI1P35226 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMI1P35226 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMI1P35226 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BMI1P35226 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMI1P35226 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMI1P35226 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMI1P35226 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMI1P35226 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BMI1P35226 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMI1P35226 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMI1P35226 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMI1P35226 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMI1P35226 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BMI1P35226 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BMI1P35226 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMI1P35226 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMI1P35226 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BMI1P35226 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMI1P35226 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BMI1P35226 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMI1P35226 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BMI1P35226 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BMI1P35226 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BMI1P35226 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BMI1P35226 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BMI1P35226 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BMI1P35226 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BMI1P35226 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BMI1P35226 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BMI1P35226 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BMI1P35226 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BMI1P35226 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BMI1P35226 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BMI1P35226 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BMI1P35226 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BMI1P35226 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BMI1P35226 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BMI1P35226 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BMI1P35226 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BMI1P35226 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BMI1P35226 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BMI1P35226 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BMI1P35226 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BMI1P35226 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BMI1P35226 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BMI1P35226 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BMI1P35226 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BMI1P35226 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BMI1P35226 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BMI1P35226 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BMI1P35226 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BMI1P35226 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BMI1P35226 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BMI1P35226 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BMI1P35226 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BMI1P35226 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BMI1P35226 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BMI1P35226 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BMI1P35226 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BMI1P35226 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMI1P35226 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BMI1P35226 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms