Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB6P28072 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB6P28072 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB6P28072 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSMB6P28072 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMB6P28072 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms