Protein–RNA interactions for Protein: P27658

COL8A1, Collagen alpha-1(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A1P27658 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COL8A1P27658 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL8A1P27658 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COL8A1P27658 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COL8A1P27658 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL8A1P27658 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL8A1P27658 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL8A1P27658 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL8A1P27658 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL8A1P27658 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL8A1P27658 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL8A1P27658 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL8A1P27658 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL8A1P27658 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COL8A1P27658 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL8A1P27658 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL8A1P27658 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL8A1P27658 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL8A1P27658 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL8A1P27658 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL8A1P27658 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL8A1P27658 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL8A1P27658 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL8A1P27658 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms