Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYF6P23409 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYF6P23409 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYF6P23409 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYF6P23409 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYF6P23409 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYF6P23409 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYF6P23409 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYF6P23409 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYF6P23409 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYF6P23409 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYF6P23409 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYF6P23409 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYF6P23409 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYF6P23409 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYF6P23409 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYF6P23409 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYF6P23409 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYF6P23409 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYF6P23409 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYF6P23409 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYF6P23409 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYF6P23409 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYF6P23409 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYF6P23409 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYF6P23409 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYF6P23409 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYF6P23409 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYF6P23409 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYF6P23409 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYF6P23409 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYF6P23409 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYF6P23409 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYF6P23409 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYF6P23409 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYF6P23409 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYF6P23409 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYF6P23409 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYF6P23409 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYF6P23409 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYF6P23409 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYF6P23409 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYF6P23409 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYF6P23409 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYF6P23409 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYF6P23409 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYF6P23409 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYF6P23409 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYF6P23409 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYF6P23409 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYF6P23409 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYF6P23409 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYF6P23409 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYF6P23409 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYF6P23409 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYF6P23409 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYF6P23409 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYF6P23409 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYF6P23409 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MYF6P23409 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYF6P23409 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYF6P23409 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYF6P23409 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYF6P23409 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF6P23409 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF6P23409 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF6P23409 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF6P23409 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYF6P23409 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF6P23409 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF6P23409 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYF6P23409 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF6P23409 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF6P23409 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF6P23409 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF6P23409 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYF6P23409 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF6P23409 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYF6P23409 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF6P23409 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF6P23409 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF6P23409 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF6P23409 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYF6P23409 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MYF6P23409 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYF6P23409 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF6P23409 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF6P23409 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF6P23409 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF6P23409 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF6P23409 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF6P23409 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYF6P23409 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYF6P23409 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYF6P23409 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYF6P23409 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYF6P23409 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYF6P23409 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYF6P23409 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYF6P23409 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms