Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCP2P22307 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCP2P22307 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCP2P22307 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCP2P22307 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCP2P22307 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCP2P22307 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCP2P22307 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCP2P22307 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCP2P22307 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCP2P22307 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCP2P22307 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCP2P22307 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCP2P22307 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCP2P22307 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCP2P22307 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCP2P22307 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCP2P22307 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCP2P22307 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCP2P22307 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCP2P22307 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCP2P22307 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCP2P22307 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SCP2P22307 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCP2P22307 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCP2P22307 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCP2P22307 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCP2P22307 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCP2P22307 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCP2P22307 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCP2P22307 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCP2P22307 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SCP2P22307 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCP2P22307 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCP2P22307 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCP2P22307 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCP2P22307 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCP2P22307 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCP2P22307 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCP2P22307 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCP2P22307 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCP2P22307 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCP2P22307 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCP2P22307 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCP2P22307 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCP2P22307 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCP2P22307 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCP2P22307 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCP2P22307 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCP2P22307 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCP2P22307 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCP2P22307 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCP2P22307 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SCP2P22307 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCP2P22307 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCP2P22307 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCP2P22307 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SCP2P22307 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCP2P22307 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCP2P22307 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCP2P22307 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SCP2P22307 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SCP2P22307 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SCP2P22307 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCP2P22307 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SCP2P22307 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCP2P22307 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SCP2P22307 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCP2P22307 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SCP2P22307 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SCP2P22307 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SCP2P22307 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SCP2P22307 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SCP2P22307 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SCP2P22307 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SCP2P22307 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCP2P22307 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCP2P22307 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SCP2P22307 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCP2P22307 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCP2P22307 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCP2P22307 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SCP2P22307 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCP2P22307 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCP2P22307 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCP2P22307 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCP2P22307 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SCP2P22307 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCP2P22307 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCP2P22307 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCP2P22307 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCP2P22307 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCP2P22307 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCP2P22307 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCP2P22307 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCP2P22307 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCP2P22307 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCP2P22307 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCP2P22307 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCP2P22307 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms