Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CASTP20810 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CASTP20810 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CASTP20810 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CASTP20810 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CASTP20810 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CASTP20810 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CASTP20810 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CASTP20810 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CASTP20810 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CASTP20810 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CASTP20810 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CASTP20810 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CASTP20810 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CASTP20810 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CASTP20810 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CASTP20810 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CASTP20810 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CASTP20810 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CASTP20810 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CASTP20810 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CASTP20810 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CASTP20810 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CASTP20810 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CASTP20810 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CASTP20810 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CASTP20810 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CASTP20810 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CASTP20810 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CASTP20810 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CASTP20810 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CASTP20810 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CASTP20810 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CASTP20810 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CASTP20810 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CASTP20810 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CASTP20810 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CASTP20810 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CASTP20810 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CASTP20810 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CASTP20810 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CASTP20810 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CASTP20810 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CASTP20810 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CASTP20810 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CASTP20810 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CASTP20810 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CASTP20810 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CASTP20810 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CASTP20810 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CASTP20810 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CASTP20810 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CASTP20810 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CASTP20810 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CASTP20810 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CASTP20810 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CASTP20810 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CASTP20810 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CASTP20810 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CASTP20810 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CASTP20810 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CASTP20810 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CASTP20810 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CASTP20810 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CASTP20810 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CASTP20810 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CASTP20810 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CASTP20810 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CASTP20810 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CASTP20810 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CASTP20810 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CASTP20810 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CASTP20810 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CASTP20810 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CASTP20810 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CASTP20810 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CASTP20810 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CASTP20810 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CASTP20810 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASTP20810 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASTP20810 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASTP20810 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASTP20810 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASTP20810 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CASTP20810 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CASTP20810 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CASTP20810 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CASTP20810 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CASTP20810 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CASTP20810 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CASTP20810 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CASTP20810 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CASTP20810 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASTP20810 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASTP20810 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASTP20810 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASTP20810 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASTP20810 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASTP20810 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CASTP20810 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms