Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD58P19256 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CD58P19256 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CD58P19256 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD58P19256 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD58P19256 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD58P19256 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD58P19256 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CD58P19256 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CD58P19256 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD58P19256 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD58P19256 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD58P19256 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD58P19256 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD58P19256 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD58P19256 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD58P19256 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD58P19256 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CD58P19256 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CD58P19256 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CD58P19256 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CD58P19256 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD58P19256 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD58P19256 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD58P19256 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD58P19256 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD58P19256 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD58P19256 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD58P19256 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD58P19256 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD58P19256 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD58P19256 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD58P19256 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD58P19256 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD58P19256 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD58P19256 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD58P19256 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD58P19256 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD58P19256 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD58P19256 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD58P19256 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD58P19256 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD58P19256 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD58P19256 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD58P19256 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD58P19256 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD58P19256 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD58P19256 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CD58P19256 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD58P19256 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD58P19256 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD58P19256 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CD58P19256 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD58P19256 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD58P19256 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD58P19256 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CD58P19256 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD58P19256 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CD58P19256 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CD58P19256 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD58P19256 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD58P19256 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CD58P19256 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD58P19256 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD58P19256 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD58P19256 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD58P19256 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD58P19256 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CD58P19256 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD58P19256 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD58P19256 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD58P19256 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD58P19256 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD58P19256 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD58P19256 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CD58P19256 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD58P19256 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD58P19256 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD58P19256 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD58P19256 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CD58P19256 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD58P19256 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD58P19256 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD58P19256 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD58P19256 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD58P19256 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD58P19256 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD58P19256 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD58P19256 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD58P19256 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD58P19256 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD58P19256 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD58P19256 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD58P19256 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD58P19256 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD58P19256 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD58P19256 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CD58P19256 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD58P19256 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD58P19256 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms