Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYN1P17600 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYN1P17600 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYN1P17600 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYN1P17600 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYN1P17600 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYN1P17600 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYN1P17600 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYN1P17600 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYN1P17600 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SYN1P17600 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYN1P17600 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYN1P17600 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYN1P17600 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYN1P17600 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYN1P17600 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYN1P17600 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYN1P17600 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYN1P17600 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYN1P17600 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYN1P17600 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYN1P17600 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYN1P17600 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYN1P17600 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYN1P17600 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYN1P17600 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYN1P17600 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYN1P17600 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SYN1P17600 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYN1P17600 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYN1P17600 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYN1P17600 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYN1P17600 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYN1P17600 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYN1P17600 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYN1P17600 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYN1P17600 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYN1P17600 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYN1P17600 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYN1P17600 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYN1P17600 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYN1P17600 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYN1P17600 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYN1P17600 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYN1P17600 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYN1P17600 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYN1P17600 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYN1P17600 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYN1P17600 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYN1P17600 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYN1P17600 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SYN1P17600 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYN1P17600 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYN1P17600 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SYN1P17600 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SYN1P17600 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYN1P17600 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYN1P17600 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYN1P17600 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYN1P17600 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYN1P17600 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYN1P17600 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYN1P17600 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYN1P17600 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYN1P17600 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYN1P17600 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYN1P17600 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYN1P17600 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYN1P17600 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYN1P17600 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SYN1P17600 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYN1P17600 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYN1P17600 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYN1P17600 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYN1P17600 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYN1P17600 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYN1P17600 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYN1P17600 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYN1P17600 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYN1P17600 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYN1P17600 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYN1P17600 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYN1P17600 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYN1P17600 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYN1P17600 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYN1P17600 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYN1P17600 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYN1P17600 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYN1P17600 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYN1P17600 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYN1P17600 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYN1P17600 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYN1P17600 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYN1P17600 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYN1P17600 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYN1P17600 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYN1P17600 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYN1P17600 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYN1P17600 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYN1P17600 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms