Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACANP16112 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACANP16112 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACANP16112 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACANP16112 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACANP16112 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACANP16112 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACANP16112 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACANP16112 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACANP16112 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACANP16112 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACANP16112 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACANP16112 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACANP16112 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACANP16112 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACANP16112 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACANP16112 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACANP16112 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACANP16112 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACANP16112 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACANP16112 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACANP16112 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACANP16112 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACANP16112 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACANP16112 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACANP16112 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACANP16112 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACANP16112 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACANP16112 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACANP16112 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACANP16112 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACANP16112 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACANP16112 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACANP16112 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACANP16112 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACANP16112 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACANP16112 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACANP16112 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACANP16112 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACANP16112 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACANP16112 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACANP16112 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACANP16112 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACANP16112 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACANP16112 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACANP16112 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACANP16112 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACANP16112 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACANP16112 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACANP16112 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACANP16112 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACANP16112 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACANP16112 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACANP16112 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACANP16112 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACANP16112 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACANP16112 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACANP16112 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACANP16112 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACANP16112 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACANP16112 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACANP16112 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACANP16112 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACANP16112 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACANP16112 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ACANP16112 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACANP16112 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACANP16112 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACANP16112 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACANP16112 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACANP16112 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACANP16112 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACANP16112 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACANP16112 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACANP16112 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACANP16112 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACANP16112 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACANP16112 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACANP16112 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACANP16112 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACANP16112 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACANP16112 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACANP16112 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACANP16112 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACANP16112 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACANP16112 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACANP16112 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACANP16112 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACANP16112 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACANP16112 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms