Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PLS3P13797 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLS3P13797 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLS3P13797 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLS3P13797 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PLS3P13797 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLS3P13797 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLS3P13797 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLS3P13797 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLS3P13797 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLS3P13797 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLS3P13797 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLS3P13797 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLS3P13797 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLS3P13797 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLS3P13797 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PLS3P13797 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLS3P13797 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLS3P13797 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLS3P13797 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLS3P13797 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLS3P13797 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLS3P13797 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLS3P13797 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLS3P13797 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PLS3P13797 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLS3P13797 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLS3P13797 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLS3P13797 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLS3P13797 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLS3P13797 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PLS3P13797 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLS3P13797 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLS3P13797 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PLS3P13797 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLS3P13797 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLS3P13797 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLS3P13797 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLS3P13797 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLS3P13797 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLS3P13797 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLS3P13797 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLS3P13797 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLS3P13797 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLS3P13797 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLS3P13797 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLS3P13797 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLS3P13797 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLS3P13797 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLS3P13797 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLS3P13797 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLS3P13797 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLS3P13797 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLS3P13797 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLS3P13797 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLS3P13797 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLS3P13797 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PLS3P13797 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLS3P13797 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLS3P13797 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLS3P13797 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLS3P13797 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLS3P13797 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLS3P13797 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLS3P13797 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLS3P13797 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLS3P13797 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLS3P13797 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLS3P13797 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLS3P13797 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLS3P13797 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLS3P13797 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLS3P13797 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLS3P13797 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLS3P13797 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLS3P13797 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLS3P13797 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLS3P13797 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLS3P13797 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PLS3P13797 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLS3P13797 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLS3P13797 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLS3P13797 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLS3P13797 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLS3P13797 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLS3P13797 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLS3P13797 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLS3P13797 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLS3P13797 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLS3P13797 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLS3P13797 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PLS3P13797 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PLS3P13797 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLS3P13797 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLS3P13797 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLS3P13797 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLS3P13797 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLS3P13797 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLS3P13797 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLS3P13797 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms