Protein–RNA interactions for Protein: P11844

CRYGA, Gamma-crystallin A, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGAP11844 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRYGAP11844 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRYGAP11844 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRYGAP11844 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYGAP11844 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRYGAP11844 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRYGAP11844 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRYGAP11844 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRYGAP11844 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CRYGAP11844 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms