Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC192P0DO97 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC192P0DO97 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC192P0DO97 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC192P0DO97 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC192P0DO97 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC192P0DO97 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC192P0DO97 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC192P0DO97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC192P0DO97 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC192P0DO97 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC192P0DO97 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC192P0DO97 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC192P0DO97 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC192P0DO97 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC192P0DO97 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC192P0DO97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC192P0DO97 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC192P0DO97 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC192P0DO97 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC192P0DO97 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms