Protein–RNA interactions for Protein: P03905

MT-ND4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND4P03905 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND4P03905 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MT-ND4P03905 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MT-ND4P03905 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MT-ND4P03905 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MT-ND4P03905 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MT-ND4P03905 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms