Protein–RNA interactions for Protein: P02724

GYPA, Glycophorin-A, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPAP02724 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYPAP02724 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYPAP02724 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GYPAP02724 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYPAP02724 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYPAP02724 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYPAP02724 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GYPAP02724 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYPAP02724 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GYPAP02724 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GYPAP02724 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYPAP02724 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYPAP02724 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYPAP02724 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GYPAP02724 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYPAP02724 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYPAP02724 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GYPAP02724 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GYPAP02724 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYPAP02724 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYPAP02724 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYPAP02724 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GYPAP02724 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYPAP02724 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYPAP02724 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GYPAP02724 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYPAP02724 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYPAP02724 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GYPAP02724 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GYPAP02724 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GYPAP02724 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYPAP02724 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GYPAP02724 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GYPAP02724 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYPAP02724 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYPAP02724 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYPAP02724 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GYPAP02724 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GYPAP02724 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GYPAP02724 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYPAP02724 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GYPAP02724 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GYPAP02724 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GYPAP02724 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYPAP02724 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GYPAP02724 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GYPAP02724 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GYPAP02724 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GYPAP02724 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GYPAP02724 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GYPAP02724 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GYPAP02724 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GYPAP02724 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GYPAP02724 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GYPAP02724 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GYPAP02724 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GYPAP02724 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GYPAP02724 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GYPAP02724 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GYPAP02724 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GYPAP02724 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GYPAP02724 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GYPAP02724 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GYPAP02724 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GYPAP02724 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GYPAP02724 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GYPAP02724 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GYPAP02724 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GYPAP02724 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GYPAP02724 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GYPAP02724 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GYPAP02724 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GYPAP02724 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GYPAP02724 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GYPAP02724 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GYPAP02724 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GYPAP02724 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GYPAP02724 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GYPAP02724 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GYPAP02724 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GYPAP02724 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GYPAP02724 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GYPAP02724 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GYPAP02724 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GYPAP02724 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GYPAP02724 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GYPAP02724 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GYPAP02724 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GYPAP02724 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GYPAP02724 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GYPAP02724 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GYPAP02724 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GYPAP02724 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GYPAP02724 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GYPAP02724 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GYPAP02724 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GYPAP02724 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GYPAP02724 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GYPAP02724 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GYPAP02724 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms