Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-HP01893 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-HP01893 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-HP01893 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-HP01893 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-HP01893 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-HP01893 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms