Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NDST3O95803 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDST3O95803 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDST3O95803 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDST3O95803 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDST3O95803 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDST3O95803 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDST3O95803 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NDST3O95803 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDST3O95803 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDST3O95803 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDST3O95803 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDST3O95803 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDST3O95803 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDST3O95803 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDST3O95803 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDST3O95803 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDST3O95803 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDST3O95803 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDST3O95803 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDST3O95803 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDST3O95803 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NDST3O95803 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDST3O95803 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NDST3O95803 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NDST3O95803 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NDST3O95803 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDST3O95803 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDST3O95803 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDST3O95803 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDST3O95803 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDST3O95803 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDST3O95803 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDST3O95803 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDST3O95803 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDST3O95803 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDST3O95803 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST3O95803 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST3O95803 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST3O95803 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDST3O95803 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDST3O95803 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDST3O95803 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDST3O95803 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NDST3O95803 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NDST3O95803 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDST3O95803 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDST3O95803 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDST3O95803 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDST3O95803 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDST3O95803 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDST3O95803 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDST3O95803 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDST3O95803 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDST3O95803 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDST3O95803 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDST3O95803 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDST3O95803 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NDST3O95803 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDST3O95803 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NDST3O95803 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NDST3O95803 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST3O95803 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST3O95803 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST3O95803 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDST3O95803 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST3O95803 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST3O95803 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST3O95803 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST3O95803 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST3O95803 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST3O95803 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDST3O95803 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDST3O95803 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDST3O95803 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDST3O95803 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDST3O95803 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDST3O95803 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST3O95803 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST3O95803 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST3O95803 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NDST3O95803 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NDST3O95803 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDST3O95803 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST3O95803 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDST3O95803 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDST3O95803 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDST3O95803 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NDST3O95803 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDST3O95803 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDST3O95803 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDST3O95803 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDST3O95803 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDST3O95803 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDST3O95803 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDST3O95803 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NDST3O95803 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDST3O95803 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDST3O95803 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NDST3O95803 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms