Protein–RNA interactions for Protein: O95744

PMS2P2, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P2O95744 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMS2P2O95744 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMS2P2O95744 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P2O95744 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P2O95744 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMS2P2O95744 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P2O95744 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms