Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.27e-7■■■■■ 81.4
DKC1O60832 ZGPAT-208ENST00000472711 787 ntTSL 322.54■■□□□ 1.27e-7■■■■■ 81.4
DKC1O60832 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.077e-7■■■■■ 81.4
DKC1O60832 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.887e-7■■■■■ 81.4
DKC1O60832 ZGPAT-207ENST00000468235 594 ntTSL 1 (best)20.44■□□□□ 0.867e-7■■■■■ 81.4
DKC1O60832 ZGPAT-210ENST00000478385 935 ntTSL 219.21■□□□□ 0.677e-7■■■■■ 81.4
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DKC1O60832 ZGPAT-209ENST00000477340 2831 ntTSL 216.91■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 81.4
DKC1O60832 TRIO-221ENST00000513206 7995 ntTSL 518■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 81.1
DKC1O60832 TRIO-222ENST00000515144 7455 ntTSL 1 (best)16.05■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 81.1
DKC1O60832 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 81.1
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DKC1O60832 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.215e-7■■■■■ 80.3
DKC1O60832 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 79.5
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DKC1O60832 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.49□□□□□ -1.695e-14■■■■■ 79.1
DKC1O60832 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 218.44■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 78.9
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DKC1O60832 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 78.1
DKC1O60832 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.281e-9■■■■■ 78.1
DKC1O60832 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.31e-9■■■■■ 78.1
DKC1O60832 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.431e-9■■■■■ 78.1
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DKC1O60832 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.521e-63■■■■■ 78
DKC1O60832 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 311.13□□□□□ -0.631e-63■■■■■ 78
DKC1O60832 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 78
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DKC1O60832 EEF1E1-204ENST00000502429 591 ntTSL 39.72□□□□□ -0.851e-323■■■■■ 77.9
DKC1O60832 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-323■■■■■ 77.9
DKC1O60832 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.951e-323■■■■■ 77.9
DKC1O60832 CCNB1IP1-206ENST00000437553 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-323■■■■■ 77.8
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DKC1O60832 CCNB1IP1-216ENST00000557665 1331 ntTSL 511.86□□□□□ -0.511e-323■■■■■ 77.8
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DKC1O60832 CCNB1IP1-208ENST00000553516 669 ntTSL 211.51□□□□□ -0.571e-323■■■■■ 77.8
DKC1O60832 CCNB1IP1-204ENST00000398163 1604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.651e-323■■■■■ 77.8
DKC1O60832 CCNB1IP1-202ENST00000358932 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.821e-323■■■■■ 77.8
DKC1O60832 CCNB1IP1-201ENST00000353689 1305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.891e-323■■■■■ 77.8
DKC1O60832 CCNB1IP1-214ENST00000556854 1294 ntTSL 58.72□□□□□ -1.011e-323■■■■■ 77.8
DKC1O60832 CCNB1IP1-213ENST00000556563 646 ntTSL 37.23□□□□□ -1.251e-323■■■■■ 77.8
DKC1O60832 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.14□□□□□ -1.431e-323■■■■■ 77.8
DKC1O60832 CCNB1IP1-211ENST00000555348 505 ntTSL 42.87□□□□□ -1.951e-323■■■■■ 77.8
DKC1O60832 CCNB1IP1-207ENST00000553291 392 ntTSL 31.87□□□□□ -2.111e-323■■■■■ 77.8
DKC1O60832 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.272e-8■■■■■ 77.8
DKC1O60832 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.52■■■□□ 2.161e-323■■■■■ 77.6
DKC1O60832 TIMM23B-204ENST00000483296 1156 ntTSL 218.86■□□□□ 0.615e-8■■■■■ 77.4
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DKC1O60832 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 77.4
DKC1O60832 TIMM23B-203ENST00000478381 2623 ntTSL 212.44□□□□□ -0.425e-8■■■■■ 77.4
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DKC1O60832 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.366e-11■■■■■ 77.4
DKC1O60832 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.186e-11■■■■■ 77.4
DKC1O60832 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.116e-11■■■■■ 77.4
DKC1O60832 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.016e-11■■■■■ 77.4
DKC1O60832 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.046e-11■■■■■ 77.4
DKC1O60832 ATE1-204ENST00000423243 2031 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.426e-11■■■■■ 77.4
DKC1O60832 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 77.4
DKC1O60832 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 77.4
DKC1O60832 MTHFD1L-207ENST00000441122 1134 ntTSL 520.52■□□□□ 0.883e-17■■■■■ 77.2
DKC1O60832 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.454e-13■■■■■ 77.2
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DKC1O60832 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.723e-17■■■■■ 77.2
DKC1O60832 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.073e-17■■■■■ 77.2
DKC1O60832 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.623e-8■■■■■ 77.2
DKC1O60832 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.66■□□□□ 0.12e-52■■■■■ 77.2
DKC1O60832 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.53□□□□□ -0.42e-52■■■■■ 77.2
DKC1O60832 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt12.45□□□□□ -0.422e-52■■■■■ 77.2
DKC1O60832 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.94■□□□□ 0.941e-323■■■■■ 77.1
DKC1O60832 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.24■□□□□ 0.671e-323■■■■■ 77.1
DKC1O60832 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 77.1
DKC1O60832 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 77.1
DKC1O60832 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 77.1
DKC1O60832 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 217.12■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 77.1
DKC1O60832 MAPK8IP3-203ENST00000561765 2374 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 77.1
DKC1O60832 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 312.82□□□□□ -0.364e-8■■■■■ 77
DKC1O60832 TRAPPC9-207ENST00000520532 560 ntTSL 58.38□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 77
DKC1O60832 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.776e-32■■■■■ 76.3
DKC1O60832 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.855e-7■■■■■ 76.3
DKC1O60832 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 218.78■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 76.1
DKC1O60832 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 76.1
DKC1O60832 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.56□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 76.1
DKC1O60832 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 46.5□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 76.1
DKC1O60832 CDRT4-202ENST00000520956 470 ntTSL 43.03□□□□□ -1.923e-7■■■■■ 76.1
DKC1O60832 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 51.98□□□□□ -2.093e-7■■■■■ 76.1
DKC1O60832 LPCAT1-206ENST00000514484 756 ntTSL 321.16■□□□□ 0.984e-19■■■■■ 76.1
DKC1O60832 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 75.9
DKC1O60832 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 75.9
DKC1O60832 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 75.9
DKC1O60832 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)7.68□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 75.9
DKC1O60832 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 75.9
DKC1O60832 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 75.9
DKC1O60832 ATG16L1-208ENST00000419681 644 ntTSL 518.05■□□□□ 0.481e-323■■■■■ 75.6
DKC1O60832 ATG16L1-217ENST00000492298 591 ntTSL 511.91□□□□□ -0.51e-323■■■■■ 75.6
DKC1O60832 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC7.37□□□□□ -1.231e-323■■■■■ 75.6
DKC1O60832 TACC1-212ENST00000521050 491 ntTSL 1 (best)18.94■□□□□ 0.623e-11■■■■■ 75.5
DKC1O60832 TACC1-216ENST00000521642 493 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.453e-11■■■■■ 75.5
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