Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF9O60383 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDF9O60383 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDF9O60383 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GDF9O60383 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDF9O60383 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GDF9O60383 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF9O60383 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF9O60383 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF9O60383 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF9O60383 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF9O60383 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF9O60383 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF9O60383 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF9O60383 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF9O60383 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF9O60383 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF9O60383 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF9O60383 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF9O60383 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF9O60383 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF9O60383 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF9O60383 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF9O60383 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF9O60383 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF9O60383 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF9O60383 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF9O60383 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF9O60383 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF9O60383 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF9O60383 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF9O60383 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF9O60383 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF9O60383 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF9O60383 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF9O60383 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF9O60383 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF9O60383 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF9O60383 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF9O60383 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF9O60383 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF9O60383 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF9O60383 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF9O60383 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF9O60383 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF9O60383 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDF9O60383 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GDF9O60383 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GDF9O60383 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GDF9O60383 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF9O60383 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDF9O60383 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF9O60383 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF9O60383 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF9O60383 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GDF9O60383 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GDF9O60383 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF9O60383 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF9O60383 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GDF9O60383 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GDF9O60383 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GDF9O60383 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GDF9O60383 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GDF9O60383 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GDF9O60383 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GDF9O60383 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GDF9O60383 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF9O60383 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF9O60383 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF9O60383 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF9O60383 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF9O60383 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF9O60383 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF9O60383 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF9O60383 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF9O60383 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF9O60383 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF9O60383 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF9O60383 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF9O60383 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF9O60383 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDF9O60383 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF9O60383 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GDF9O60383 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GDF9O60383 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GDF9O60383 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF9O60383 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF9O60383 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF9O60383 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF9O60383 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF9O60383 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF9O60383 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF9O60383 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF9O60383 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF9O60383 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF9O60383 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF9O60383 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF9O60383 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms