Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP8B1O43520 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP8B1O43520 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATP8B1O43520 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8B1O43520 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8B1O43520 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms