Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPLO15194 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTDSPLO15194 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPLO15194 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTDSPLO15194 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPLO15194 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms