Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MUSKO15146 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MUSKO15146 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MUSKO15146 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MUSKO15146 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUSKO15146 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUSKO15146 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUSKO15146 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUSKO15146 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUSKO15146 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MUSKO15146 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUSKO15146 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUSKO15146 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUSKO15146 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUSKO15146 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MUSKO15146 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MUSKO15146 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MUSKO15146 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MUSKO15146 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUSKO15146 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUSKO15146 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MUSKO15146 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUSKO15146 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MUSKO15146 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MUSKO15146 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MUSKO15146 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MUSKO15146 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MUSKO15146 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MUSKO15146 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MUSKO15146 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MUSKO15146 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MUSKO15146 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MUSKO15146 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MUSKO15146 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MUSKO15146 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MUSKO15146 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MUSKO15146 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MUSKO15146 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MUSKO15146 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MUSKO15146 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUSKO15146 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MUSKO15146 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MUSKO15146 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MUSKO15146 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUSKO15146 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUSKO15146 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUSKO15146 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUSKO15146 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUSKO15146 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUSKO15146 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MUSKO15146 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MUSKO15146 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MUSKO15146 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MUSKO15146 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MUSKO15146 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MUSKO15146 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MUSKO15146 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MUSKO15146 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MUSKO15146 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MUSKO15146 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MUSKO15146 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MUSKO15146 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MUSKO15146 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MUSKO15146 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MUSKO15146 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUSKO15146 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUSKO15146 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MUSKO15146 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MUSKO15146 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MUSKO15146 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MUSKO15146 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUSKO15146 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MUSKO15146 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUSKO15146 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUSKO15146 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUSKO15146 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUSKO15146 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MUSKO15146 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MUSKO15146 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MUSKO15146 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MUSKO15146 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUSKO15146 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUSKO15146 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUSKO15146 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUSKO15146 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUSKO15146 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MUSKO15146 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MUSKO15146 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUSKO15146 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MUSKO15146 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUSKO15146 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUSKO15146 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MUSKO15146 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUSKO15146 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUSKO15146 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUSKO15146 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUSKO15146 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MUSKO15146 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MUSKO15146 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MUSKO15146 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms