Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
B4E1Z4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
B4E1Z4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
B4E1Z4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
B4E1Z4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
B4E1Z4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
B4E1Z4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
B4E1Z4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
B4E1Z4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
B4E1Z4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
B4E1Z4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
B4E1Z4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
B4E1Z4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
B4E1Z4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
B4E1Z4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
B4E1Z4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
B4E1Z4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
B4E1Z4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
B4E1Z4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
B4E1Z4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
B4E1Z4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
B4E1Z4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
B4E1Z4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
B4E1Z4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
B4E1Z4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
B4E1Z4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
B4E1Z4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
B4E1Z4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
B4E1Z4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
B4E1Z4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
B4E1Z4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
B4E1Z4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
B4E1Z4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
B4E1Z4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
B4E1Z4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
B4E1Z4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
B4E1Z4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
B4E1Z4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
B4E1Z4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
B4E1Z4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
B4E1Z4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
B4E1Z4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
B4E1Z4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
B4E1Z4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
B4E1Z4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
B4E1Z4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
B4E1Z4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
B4E1Z4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
B4E1Z4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
B4E1Z4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
B4E1Z4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
B4E1Z4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
B4E1Z4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
B4E1Z4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
B4E1Z4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
B4E1Z4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
B4E1Z4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
B4E1Z4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
B4E1Z4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
B4E1Z4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
B4E1Z4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
B4E1Z4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
B4E1Z4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
B4E1Z4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
B4E1Z4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
B4E1Z4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
B4E1Z4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
B4E1Z4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
B4E1Z4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
B4E1Z4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
B4E1Z4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
B4E1Z4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
B4E1Z4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
B4E1Z4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
B4E1Z4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
B4E1Z4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
B4E1Z4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
B4E1Z4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
B4E1Z4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
B4E1Z4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
B4E1Z4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
B4E1Z4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
B4E1Z4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
B4E1Z4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
B4E1Z4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
B4E1Z4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
B4E1Z4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
B4E1Z4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
B4E1Z4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
B4E1Z4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
B4E1Z4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
B4E1Z4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
B4E1Z4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
B4E1Z4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
B4E1Z4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
B4E1Z4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
B4E1Z4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
B4E1Z4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
B4E1Z4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
B4E1Z4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1163.2 ms