Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
B4E1Z4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
B4E1Z4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
B4E1Z4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
B4E1Z4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
B4E1Z4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
B4E1Z4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
B4E1Z4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
B4E1Z4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
B4E1Z4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
B4E1Z4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
B4E1Z4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
B4E1Z4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
B4E1Z4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
B4E1Z4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
B4E1Z4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
B4E1Z4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
B4E1Z4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
B4E1Z4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
B4E1Z4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
B4E1Z4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
B4E1Z4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
B4E1Z4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
B4E1Z4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
B4E1Z4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
B4E1Z4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
B4E1Z4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
B4E1Z4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
B4E1Z4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
B4E1Z4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
B4E1Z4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
B4E1Z4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
B4E1Z4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
B4E1Z4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
B4E1Z4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
B4E1Z4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
B4E1Z4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
B4E1Z4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
B4E1Z4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
B4E1Z4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
B4E1Z4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
B4E1Z4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
B4E1Z4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
B4E1Z4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
B4E1Z4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
B4E1Z4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
B4E1Z4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
B4E1Z4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
B4E1Z4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
B4E1Z4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
B4E1Z4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
B4E1Z4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
B4E1Z4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
B4E1Z4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
B4E1Z4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
B4E1Z4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
B4E1Z4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
B4E1Z4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
B4E1Z4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
B4E1Z4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
B4E1Z4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
B4E1Z4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
B4E1Z4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
B4E1Z4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
B4E1Z4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
B4E1Z4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
B4E1Z4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
B4E1Z4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
B4E1Z4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
B4E1Z4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
B4E1Z4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
B4E1Z4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
B4E1Z4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
B4E1Z4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
B4E1Z4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
B4E1Z4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
B4E1Z4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
B4E1Z4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
B4E1Z4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
B4E1Z4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
B4E1Z4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
B4E1Z4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
B4E1Z4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
B4E1Z4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
B4E1Z4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
B4E1Z4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
B4E1Z4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
B4E1Z4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
B4E1Z4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
B4E1Z4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
B4E1Z4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
B4E1Z4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
B4E1Z4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
B4E1Z4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
B4E1Z4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
B4E1Z4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
B4E1Z4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
B4E1Z4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
B4E1Z4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
B4E1Z4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms