Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SAC3D1A6NKF1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAC3D1A6NKF1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SAC3D1A6NKF1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAC3D1A6NKF1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAC3D1A6NKF1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAC3D1A6NKF1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAC3D1A6NKF1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAC3D1A6NKF1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAC3D1A6NKF1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
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