Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNOT1A5YKK6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT1A5YKK6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT1A5YKK6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT1A5YKK6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT1A5YKK6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT1A5YKK6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT1A5YKK6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT1A5YKK6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT1A5YKK6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT1A5YKK6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT1A5YKK6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT1A5YKK6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT1A5YKK6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT1A5YKK6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNOT1A5YKK6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms