Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf170A2RU37 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf170A2RU37 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf170A2RU37 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf170A2RU37 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C9orf170A2RU37 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf170A2RU37 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms