Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR3EQ9NVU0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms