Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSPOP30536 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPOP30536 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPOP30536 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPOP30536 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPOP30536 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TSPOP30536 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSPOP30536 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSPOP30536 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms