Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COX6A1P12074 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COX6A1P12074 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COX6A1P12074 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COX6A1P12074 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COX6A1P12074 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COX6A1P12074 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms