Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTMAP06454 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTMAP06454 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTMAP06454 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTMAP06454 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms