Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP8B3O60423 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP8B3O60423 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms