Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BARX2Q9UMQ3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARX2Q9UMQ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms