Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLCO1B3Q9NPD5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLCO1B3Q9NPD5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms