Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SNHG12Q9BXW3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms