Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN18Q96SJ8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN18Q96SJ8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms