Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD30

GPT2, Alanine aminotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPT2Q8TD30 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPT2Q8TD30 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPT2Q8TD30 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms