Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP78Q5JTW2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP78Q5JTW2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms