Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 NEDD1-205ENST00000553609 581 ntTSL 314.75□□□□□ -0.051e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 BOLA3-AS1-202ENST00000529783 631 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.171e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 213.72□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCAP-205ENST00000420588 546 ntTSL 413.43□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SSH2-205ENST00000577483 1630 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.371e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 ASB3-211ENST00000482829 1910 ntTSL 512.68□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-202ENST00000411739 2490 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SSH2-208ENST00000579040 965 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.541e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SSH2-203ENST00000394848 1796 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.541e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCAP-214ENST00000495603 706 ntTSL 211.27□□□□□ -0.611e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 BOLA3-AS1-203ENST00000533563 1599 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.651e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-201ENST00000360051 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.711e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-211ENST00000557454 564 ntTSL 410.27□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 EPS15-201ENST00000371727 1773 ntTSL 210.12□□□□□ -0.791e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 HERC1-209ENST00000560519 591 ntTSL 39.96□□□□□ -0.821e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.871e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 59.45□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 BOLA3-AS1-201ENST00000423477 1804 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.941e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-203ENST00000429527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.961e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 MGME1-205ENST00000467391 740 ntTSL 1 (best)8.9□□□□□ -0.981e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SSH2-212ENST00000592397 574 ntTSL 48.57□□□□□ -1.041e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 MGME1-204ENST00000463219 571 ntTSL 38.43□□□□□ -1.061e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-237ENST00000481500 756 ntTSL 28.38□□□□□ -1.071e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.131e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NOSTRIN-205ENST00000439509 584 ntTSL 37.8□□□□□ -1.161e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NOSTRIN-208ENST00000447264 794 ntTSL 57.8□□□□□ -1.161e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.281e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 AC025171.1-203ENST00000503152 608 ntTSL 26.93□□□□□ -1.31e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-239ENST00000484167 668 ntTSL 26.52□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 EPS15-205ENST00000465467 374 ntTSL 56.46□□□□□ -1.381e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.391e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.411e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SEPT2-228ENST00000464128 565 ntTSL 46.17□□□□□ -1.421e-6■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.431e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.481e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 GTF2I-209ENST00000484840 574 ntTSL 45.72□□□□□ -1.491e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.491e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.521e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 ASB3-203ENST00000406053 2648 ntTSL 55.49□□□□□ -1.531e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.541e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.541e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.561e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 EPS15-206ENST00000471391 731 ntTSL 25.12□□□□□ -1.591e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.841e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.051e-7■■■■□ 24.6
TARDBPQ13148 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.941e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.061e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.181e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.149e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 213.4□□□□□ -0.261e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 FAF1-205ENST00000494400 2127 ntTSL 29.61□□□□□ -0.875e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 MKNK1-225ENST00000531769 567 ntTSL 412.34□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PRPF40A-202ENST00000410080 8048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.642e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PRPF40A-206ENST00000471167 333 ntTSL 26.77□□□□□ -1.332e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PRPF40A-207ENST00000471701 293 ntTSL 24.61□□□□□ -1.672e-7■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PTPRJ-206ENST00000534219 546 ntTSL 325.2■■□□□ 1.622e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PTPRJ-205ENST00000527952 626 ntTSL 524.67■■□□□ 1.542e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.942e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.192e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.355e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.555e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 521.31■■□□□ 11e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 216.7■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 IGF2BP3-203ENST00000465058 534 ntTSL 415.31■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 IGF2BP3-211ENST00000479504 559 ntTSL 415.31■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 IGF2BP3-204ENST00000466809 588 ntTSL 514.49□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 510.15□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 IGF2BP3-208ENST00000469723 556 ntTSL 58.43□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 24.5
TARDBPQ13148 XYLB-204ENST00000472721 546 ntTSL 413.31□□□□□ -0.285e-7■■■■□ 24.5
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 376.7 ms