Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 APBA2-209ENST00000559709 594 ntTSL 426.83■■□□□ 1.891e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)23.1■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 421.77■■□□□ 1.087e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 321.77■■□□□ 1.087e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 419.92■□□□□ 0.787e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.637e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 315.54■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 LIN54-208ENST00000509748 729 ntTSL 523.72■■□□□ 1.395e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.35e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 LIN54-210ENST00000510877 4507 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 LIN54-203ENST00000446851 4083 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 SLC4A2-218ENST00000494125 782 ntTSL 227.06■■□□□ 1.928e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 SLC4A2-213ENST00000483786 571 ntTSL 418.09■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 MBOAT7-212ENST00000494142 3039 ntTSL 1 (best)19.61■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.196e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.16e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.946e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.786e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 CALM3-213ENST00000602169 590 ntTSL 214.02□□□□□ -0.176e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 CALM3-203ENST00000477244 696 ntTSL 313.15□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 CALM3-210ENST00000597868 927 ntTSL 312.02□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 312.67□□□□□ -0.385e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 36.42□□□□□ -1.385e-8■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 ANPEP-209ENST00000560137 638 ntTSL 317.6■□□□□ 0.412e-14■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-14■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 ANPEP-205ENST00000559874 663 ntTSL 311.1□□□□□ -0.632e-14■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 PCGF3-206ENST00000433814 639 ntTSL 417.54■□□□□ 0.45e-9■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 NDUFS7-206ENST00000535382 3050 ntTSL 217.13■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 514.03□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 46.13□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.477e-9■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 216.57■□□□□ 0.247e-9■■■■■ 29.3
GTF2F1P35269 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.883e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.764e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.523e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.474e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.44e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.323e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PHF21A-213ENST00000530312 276 ntTSL 328.01■■■□□ 2.073e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.983e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.963e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CRIP2-210ENST00000551836 627 ntTSL 326.83■■□□□ 1.893e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.833e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CRIP2-211ENST00000552643 1383 ntTSL 226.44■■□□□ 1.823e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TBCB-202ENST00000392178 791 ntTSL 226.3■■□□□ 1.83e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SPRED3-206ENST00000587947 646 ntTSL 325.71■■□□□ 1.713e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TNFRSF4-203ENST00000497869 1707 ntTSL 225.35■■□□□ 1.653e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CLIC4-204ENST00000497755 672 ntTSL 324.99■■□□□ 1.592e-13■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.553e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CRIP2-204ENST00000547643 1373 ntTSL 324.49■■□□□ 1.513e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.53e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.433e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.383e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AP1S1-203ENST00000443943 741 ntTSL 323.57■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-217ENST00000487006 631 ntTSL 323.53■■□□□ 1.363e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SIRT3-211ENST00000529937 2627 ntTSL 523.51■■□□□ 1.353e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.343e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.343e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ARL6IP6-205ENST00000495469 1308 ntTSL 223.38■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-214ENST00000550147 1855 ntTSL 1 (best)23.36■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 523.34■■□□□ 1.334e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SIRT3-214ENST00000532837 1588 ntTSL 223.13■■□□□ 1.293e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.253e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-202ENST00000421304 538 ntTSL 422.55■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-210ENST00000441822 632 ntTSL 322.02■■□□□ 1.123e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CLSTN3-202ENST00000331148 2288 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.112e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 221.97■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-209ENST00000548971 1493 ntTSL 521.93■■□□□ 1.13e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CRIP2-203ENST00000538259 991 ntTSL 221.65■■□□□ 1.063e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-206ENST00000430270 1260 ntTSL 521.64■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TBCB-208ENST00000588385 776 ntTSL 1 (best)21.64■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-215ENST00000528488 1623 ntTSL 221.36■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CRIP2-205ENST00000548309 1893 ntTSL 1 (best)21.31■■□□□ 13e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TBCB-209ENST00000589308 659 ntTSL 321.22■□□□□ 0.993e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-202ENST00000525807 1122 ntTSL 521.16■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CHCHD6-207ENST00000514908 713 ntTSL 321.1■□□□□ 0.973e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CRIP2-207ENST00000548989 1976 ntTSL 220.96■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-214ENST00000534038 593 ntTSL 420.94■□□□□ 0.943e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-212ENST00000549610 1116 ntTSL 1 (best)20.84■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CHCHD6-202ENST00000503119 1148 ntTSL 1 (best)20.84■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 29.2
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 281.8 ms