RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530312.1

PHF21A-213, Transcript of PHD finger protein 21A, humanhuman

TSL 3

Gene PHF21A, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21A-213ENST00000530312 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.39■■■■■ 7.58
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PHF21A-213ENST00000530312 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.05■■■■■ 5.92
PHF21A-213ENST00000530312 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.02■■■■■ 5.92
PHF21A-213ENST00000530312 NACADO15069 1562 aa51.93■■■■■ 5.9
PHF21A-213ENST00000530312 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.91■■■■■ 5.9
PHF21A-213ENST00000530312 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.69■■■■■ 5.86
PHF21A-213ENST00000530312 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.56■■■■■ 5.84
PHF21A-213ENST00000530312 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.76■■■■■ 5.72
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PHF21A-213ENST00000530312 SCRIBQ14160 1630 aa50.54■■■■■ 5.68
PHF21A-213ENST00000530312 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.5■■■■■ 5.67
PHF21A-213ENST00000530312 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.79■■■■■ 5.56
PHF21A-213ENST00000530312 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.58■■■■■ 5.53
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PHF21A-213ENST00000530312 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.83■■■■■ 5.41
PHF21A-213ENST00000530312 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.69■■■■■ 5.39
PHF21A-213ENST00000530312 SMARCA4P51532 1647 aa48.33■■■■■ 5.33
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PHF21A-213ENST00000530312 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.15■■■■■ 5.3
PHF21A-213ENST00000530312 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.09■■■■■ 5.29
PHF21A-213ENST00000530312 NCAPD3P42695 1498 aa48■■■■■ 5.27
PHF21A-213ENST00000530312 SMARCA2P51531 1590 aa47.91■■■■■ 5.26
PHF21A-213ENST00000530312 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.85■■■■■ 5.25
PHF21A-213ENST00000530312 HMGXB3Q12766 1538 aa47.71■■■■■ 5.23
PHF21A-213ENST00000530312 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.67■■■■■ 5.22
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PHF21A-213ENST00000530312 WIZO95785 1651 aa47.58■■■■■ 5.21
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PHF21A-213ENST00000530312 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.61■■■■■ 5.05
PHF21A-213ENST00000530312 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.6■■■■■ 5.05
PHF21A-213ENST00000530312 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
PHF21A-213ENST00000530312 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.58■■■■■ 5.05
PHF21A-213ENST00000530312 ERCC6Q03468 1493 aa46.45■■■■■ 5.03
PHF21A-213ENST00000530312 CFTRP13569 1480 aa46.38■■■■■ 5.02
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PHF21A-213ENST00000530312 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.07■■■■■ 4.97
PHF21A-213ENST00000530312 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
PHF21A-213ENST00000530312 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.94■■■■■ 4.95
PHF21A-213ENST00000530312 CUX2O14529 1486 aa45.89■■■■■ 4.94
PHF21A-213ENST00000530312 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.87■■■■■ 4.93
PHF21A-213ENST00000530312 PRDM2Q13029 1718 aa45.84■■■■■ 4.93
PHF21A-213ENST00000530312 WDR62O43379 1518 aa45.71■■■■■ 4.91
PHF21A-213ENST00000530312 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
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PHF21A-213ENST00000530312 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.28■■■■■ 4.84
PHF21A-213ENST00000530312 ABCC8Q09428 1581 aa45.24■■■■■ 4.83
PHF21A-213ENST00000530312 CUX1P39880 1505 aa45.15■■■■■ 4.82
PHF21A-213ENST00000530312 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
PHF21A-213ENST00000530312 IFT140Q96RY7 1462 aa44.98■■■■■ 4.79
PHF21A-213ENST00000530312 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.92■■■■■ 4.78
PHF21A-213ENST00000530312 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.89■■■■■ 4.78
PHF21A-213ENST00000530312 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.87■■■■■ 4.77
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PHF21A-213ENST00000530312 SYNJ1O43426 1573 aa44.8■■■■■ 4.76
PHF21A-213ENST00000530312 TOP2BQ02880 1626 aa44.72■■■■■ 4.75
PHF21A-213ENST00000530312 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.69■■■■■ 4.74
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PHF21A-213ENST00000530312 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
PHF21A-213ENST00000530312 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
PHF21A-213ENST00000530312 WDR97A6NE52 1622 aa44.49■■■■■ 4.71
PHF21A-213ENST00000530312 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.48■■■■■ 4.71
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PHF21A-213ENST00000530312 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.27■■■■■ 4.68
PHF21A-213ENST00000530312 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.27■■■■■ 4.68
PHF21A-213ENST00000530312 GRIN2BQ13224 1484 aa44.22■■■■■ 4.67
PHF21A-213ENST00000530312 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.19■■■■■ 4.66
PHF21A-213ENST00000530312 PBRM1Q86U86 1689 aa44.09■■■■■ 4.65
PHF21A-213ENST00000530312 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
PHF21A-213ENST00000530312 OSCARQ8IYS5 282 aa44.05■■■■■ 4.64
PHF21A-213ENST00000530312 FBLN2P98095 1184 aa43.99■■■■■ 4.63
PHF21A-213ENST00000530312 CHD1O14646 1710 aa43.96■■■■■ 4.63
PHF21A-213ENST00000530312 TRIM41Q8WV44 630 aa43.93■■■■■ 4.62
PHF21A-213ENST00000530312 SYNJ2O15056 1496 aa43.91■■■■■ 4.62
PHF21A-213ENST00000530312 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.89■■■■■ 4.62
PHF21A-213ENST00000530312 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
PHF21A-213ENST00000530312 KIF27Q86VH2 1401 aa43.87■■■■■ 4.61
PHF21A-213ENST00000530312 ADAMTS12P58397 1594 aa43.84■■■■■ 4.61
PHF21A-213ENST00000530312 IGF1RP08069 1367 aa43.8■■■■■ 4.6
PHF21A-213ENST00000530312 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.76■■■■■ 4.6
PHF21A-213ENST00000530312 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.73■■■■■ 4.59
PHF21A-213ENST00000530312 GRIN2AQ12879 1464 aa43.68■■■■■ 4.58
PHF21A-213ENST00000530312 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.64■■■■■ 4.58
PHF21A-213ENST00000530312 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.58■■■■■ 4.57
PHF21A-213ENST00000530312 NUP160Q12769 1436 aa43.51■■■■■ 4.56
PHF21A-213ENST00000530312 CEP170Q5SW79 1584 aa43.49■■■■■ 4.55
PHF21A-213ENST00000530312 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.48■■■■■ 4.55
PHF21A-213ENST00000530312 CUL7Q14999 1698 aa43.47■■■■■ 4.55
PHF21A-213ENST00000530312 ARHGEF11O15085 1522 aa43.38■■■■■ 4.53
PHF21A-213ENST00000530312 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.33■■■■■ 4.53
PHF21A-213ENST00000530312 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.33■■■■■ 4.53
PHF21A-213ENST00000530312 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.33■■■■■ 4.53
PHF21A-213ENST00000530312 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.2■■■■■ 4.51
PHF21A-213ENST00000530312 PRXQ9BXM0 1461 aa43.17■■■■■ 4.5
PHF21A-213ENST00000530312 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.14■■■■■ 4.5
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