RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587947.5

SPRED3-206, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SPRED3, Length 646 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3-206ENST00000587947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.6■■■■■ 6.65
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SPRED3-206ENST00000587947 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.74■■■■■ 5.71
SPRED3-206ENST00000587947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.44■■■■■ 5.35
SPRED3-206ENST00000587947 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.15■■■■■ 5.3
SPRED3-206ENST00000587947 NACADO15069 1562 aa48.09■■■■■ 5.29
SPRED3-206ENST00000587947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.92■■■■■ 5.26
SPRED3-206ENST00000587947 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.58■■■■■ 5.21
SPRED3-206ENST00000587947 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.37■■■■■ 5.17
SPRED3-206ENST00000587947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.28■■■■■ 5.16
SPRED3-206ENST00000587947 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.09■■■■■ 5.13
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SPRED3-206ENST00000587947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.38■■■■■ 5.01
SPRED3-206ENST00000587947 SCRIBQ14160 1630 aa46.31■■■■■ 5
SPRED3-206ENST00000587947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.06■■■■■ 4.96
SPRED3-206ENST00000587947 CECR2Q9BXF3 1484 aa46■■■■■ 4.95
SPRED3-206ENST00000587947 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.92■■■■■ 4.94
SPRED3-206ENST00000587947 NCAPD3P42695 1498 aa44.46■■■■■ 4.71
SPRED3-206ENST00000587947 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.3■■■■■ 4.68
SPRED3-206ENST00000587947 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.29■■■■■ 4.68
SPRED3-206ENST00000587947 SMARCA4P51532 1647 aa44.14■■■■■ 4.66
SPRED3-206ENST00000587947 SMARCA2P51531 1590 aa44.09■■■■■ 4.65
SPRED3-206ENST00000587947 ERCC6Q03468 1493 aa44.06■■■■■ 4.64
SPRED3-206ENST00000587947 HMGXB3Q12766 1538 aa44.04■■■■■ 4.64
SPRED3-206ENST00000587947 CUX2O14529 1486 aa44.02■■■■■ 4.64
SPRED3-206ENST00000587947 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
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SPRED3-206ENST00000587947 NESP48681 1621 aa43.82■■■■■ 4.61
SPRED3-206ENST00000587947 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.73■■■■■ 4.59
SPRED3-206ENST00000587947 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.63■■■■■ 4.58
SPRED3-206ENST00000587947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.41■■■■■ 4.54
SPRED3-206ENST00000587947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
SPRED3-206ENST00000587947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.22■■■■■ 4.51
SPRED3-206ENST00000587947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.14■■■■■ 4.5
SPRED3-206ENST00000587947 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.11■■■■■ 4.49
SPRED3-206ENST00000587947 WIZO95785 1651 aa43.05■■■■■ 4.48
SPRED3-206ENST00000587947 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.84■■■■■ 4.45
SPRED3-206ENST00000587947 WDR62O43379 1518 aa42.73■■■■■ 4.43
SPRED3-206ENST00000587947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
SPRED3-206ENST00000587947 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.63■■■■■ 4.42
SPRED3-206ENST00000587947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.6■■■■■ 4.41
SPRED3-206ENST00000587947 CFTRP13569 1480 aa42.56■■■■■ 4.4
SPRED3-206ENST00000587947 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
SPRED3-206ENST00000587947 TRIM41Q8WV44 630 aa42.27■■■■■ 4.36
SPRED3-206ENST00000587947 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
SPRED3-206ENST00000587947 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.08■■■■■ 4.33
SPRED3-206ENST00000587947 OSCARQ8IYS5 282 aa42.05■■■■■ 4.32
SPRED3-206ENST00000587947 PRDM2Q13029 1718 aa41.95■■■■■ 4.31
SPRED3-206ENST00000587947 IFT140Q96RY7 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
SPRED3-206ENST00000587947 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
SPRED3-206ENST00000587947 TOPBP1Q92547 1522 aa41.76■■■■■ 4.28
SPRED3-206ENST00000587947 ABCC8Q09428 1581 aa41.63■■■■■ 4.25
SPRED3-206ENST00000587947 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.55■■■■■ 4.24
SPRED3-206ENST00000587947 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
SPRED3-206ENST00000587947 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.45■■■■■ 4.23
SPRED3-206ENST00000587947 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.45■■■■■ 4.23
SPRED3-206ENST00000587947 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.45■■■■■ 4.23
SPRED3-206ENST00000587947 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.22
SPRED3-206ENST00000587947 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
SPRED3-206ENST00000587947 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
SPRED3-206ENST00000587947 ARHGEF11O15085 1522 aa41.34■■■■■ 4.21
SPRED3-206ENST00000587947 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.21■■■■■ 4.19
SPRED3-206ENST00000587947 FBLN2P98095 1184 aa41.17■■■■■ 4.18
SPRED3-206ENST00000587947 SOGA1O94964 1423 aa41.17■■■■■ 4.18
SPRED3-206ENST00000587947 CHD1O14646 1710 aa41.15■■■■■ 4.18
SPRED3-206ENST00000587947 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
SPRED3-206ENST00000587947 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.11■■■■■ 4.17
SPRED3-206ENST00000587947 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.04■■■■■ 4.16
SPRED3-206ENST00000587947 CUX1P39880 1505 aa40.99■■■■■ 4.15
SPRED3-206ENST00000587947 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.94■■■■■ 4.14
SPRED3-206ENST00000587947 ARAP1Q96P48 1450 aa40.94■■■■■ 4.14
SPRED3-206ENST00000587947 WDR97A6NE52 1622 aa40.89■■■■■ 4.14
SPRED3-206ENST00000587947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
SPRED3-206ENST00000587947 GRIN2BQ13224 1484 aa40.79■■■■■ 4.12
SPRED3-206ENST00000587947 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
SPRED3-206ENST00000587947 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.75■■■■■ 4.11
SPRED3-206ENST00000587947 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
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SPRED3-206ENST00000587947 SYNJ1O43426 1573 aa40.67■■■■■ 4.1
SPRED3-206ENST00000587947 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.64■■■■■ 4.1
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SPRED3-206ENST00000587947 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.48■■■■■ 4.07
SPRED3-206ENST00000587947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.39■■■■■ 4.06
SPRED3-206ENST00000587947 GRIN2AQ12879 1464 aa40.27■■■■■ 4.04
SPRED3-206ENST00000587947 TOP2BQ02880 1626 aa40.24■■■■■ 4.03
SPRED3-206ENST00000587947 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.22■■■■■ 4.03
SPRED3-206ENST00000587947 ADAMTS12P58397 1594 aa40.19■■■■■ 4.02
SPRED3-206ENST00000587947 NUP160Q12769 1436 aa40.16■■■■■ 4.02
SPRED3-206ENST00000587947 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.14■■■■■ 4.02
SPRED3-206ENST00000587947 CEP170Q5SW79 1584 aa40.13■■■■■ 4.01
SPRED3-206ENST00000587947 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.12■■■■■ 4.01
SPRED3-206ENST00000587947 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.02■■■■■ 4
SPRED3-206ENST00000587947 SHROOM2Q13796 1616 aa39.94■■■■□ 3.99
SPRED3-206ENST00000587947 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
SPRED3-206ENST00000587947 JPH4Q96JJ6 628 aa39.79■■■■□ 3.96
SPRED3-206ENST00000587947 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.62■■■■□ 3.93
SPRED3-206ENST00000587947 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
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