RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552643.5

CRIP2-211, Transcript of cysteine rich protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene CRIP2, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2-211ENST00000552643 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.87■■■■■ 7.02
CRIP2-211ENST00000552643 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.09■■■■■ 5.93
CRIP2-211ENST00000552643 ABCC9O60706 1549 aa50.62■■■■■ 5.69
CRIP2-211ENST00000552643 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.15■■■■■ 5.46
CRIP2-211ENST00000552643 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.1■■■■■ 5.45
CRIP2-211ENST00000552643 NACADO15069 1562 aa48.82■■■■■ 5.41
CRIP2-211ENST00000552643 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.8■■■■■ 5.4
CRIP2-211ENST00000552643 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.62■■■■■ 5.37
CRIP2-211ENST00000552643 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.59■■■■■ 5.37
CRIP2-211ENST00000552643 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.85■■■■■ 5.25
CRIP2-211ENST00000552643 SCRIBQ14160 1630 aa47.73■■■■■ 5.23
CRIP2-211ENST00000552643 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.41■■■■■ 5.18
CRIP2-211ENST00000552643 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.38■■■■■ 5.18
CRIP2-211ENST00000552643 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.01■■■■■ 5.12
CRIP2-211ENST00000552643 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
CRIP2-211ENST00000552643 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.01■■■■■ 4.96
CRIP2-211ENST00000552643 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.9■■■■■ 4.94
CRIP2-211ENST00000552643 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.78■■■■■ 4.92
CRIP2-211ENST00000552643 SMARCA4P51532 1647 aa45.62■■■■■ 4.89
CRIP2-211ENST00000552643 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.57■■■■■ 4.89
CRIP2-211ENST00000552643 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.46■■■■■ 4.87
CRIP2-211ENST00000552643 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.2■■■■■ 4.83
CRIP2-211ENST00000552643 SMARCA2P51531 1590 aa45.12■■■■■ 4.81
CRIP2-211ENST00000552643 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.06■■■■■ 4.8
CRIP2-211ENST00000552643 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
CRIP2-211ENST00000552643 WIZO95785 1651 aa45.05■■■■■ 4.8
CRIP2-211ENST00000552643 NCAPD3P42695 1498 aa45.03■■■■■ 4.8
CRIP2-211ENST00000552643 HMGXB3Q12766 1538 aa44.88■■■■■ 4.78
CRIP2-211ENST00000552643 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
CRIP2-211ENST00000552643 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
CRIP2-211ENST00000552643 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
CRIP2-211ENST00000552643 CCDC88BA6NC98 1476 aa44■■■■■ 4.63
CRIP2-211ENST00000552643 NESP48681 1621 aa43.98■■■■■ 4.63
CRIP2-211ENST00000552643 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.79■■■■■ 4.6
CRIP2-211ENST00000552643 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.77■■■■■ 4.6
CRIP2-211ENST00000552643 CFTRP13569 1480 aa43.62■■■■■ 4.57
CRIP2-211ENST00000552643 ERCC6Q03468 1493 aa43.53■■■■■ 4.56
CRIP2-211ENST00000552643 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.48■■■■■ 4.55
CRIP2-211ENST00000552643 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.46■■■■■ 4.55
CRIP2-211ENST00000552643 PRDM2Q13029 1718 aa43.43■■■■■ 4.54
CRIP2-211ENST00000552643 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.33■■■■■ 4.53
CRIP2-211ENST00000552643 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.22■■■■■ 4.51
CRIP2-211ENST00000552643 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
CRIP2-211ENST00000552643 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.04■■■■■ 4.48
CRIP2-211ENST00000552643 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
CRIP2-211ENST00000552643 WDR62O43379 1518 aa42.88■■■■■ 4.45
CRIP2-211ENST00000552643 CUX2O14529 1486 aa42.79■■■■■ 4.44
CRIP2-211ENST00000552643 TOPBP1Q92547 1522 aa42.71■■■■■ 4.43
CRIP2-211ENST00000552643 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.68■■■■■ 4.42
CRIP2-211ENST00000552643 ABCC8Q09428 1581 aa42.64■■■■■ 4.42
CRIP2-211ENST00000552643 CUX1P39880 1505 aa42.61■■■■■ 4.41
CRIP2-211ENST00000552643 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.46■■■■■ 4.39
CRIP2-211ENST00000552643 SYNJ1O43426 1573 aa42.43■■■■■ 4.38
CRIP2-211ENST00000552643 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
CRIP2-211ENST00000552643 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.37■■■■■ 4.37
CRIP2-211ENST00000552643 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.34■■■■■ 4.37
CRIP2-211ENST00000552643 TOP2BQ02880 1626 aa42.33■■■■■ 4.37
CRIP2-211ENST00000552643 IFT140Q96RY7 1462 aa42.25■■■■■ 4.35
CRIP2-211ENST00000552643 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.25■■■■■ 4.35
CRIP2-211ENST00000552643 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
CRIP2-211ENST00000552643 SOGA1O94964 1423 aa42.19■■■■■ 4.34
CRIP2-211ENST00000552643 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
CRIP2-211ENST00000552643 WDR97A6NE52 1622 aa42.02■■■■■ 4.32
CRIP2-211ENST00000552643 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
CRIP2-211ENST00000552643 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.94■■■■■ 4.31
CRIP2-211ENST00000552643 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
CRIP2-211ENST00000552643 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.92■■■■■ 4.3
CRIP2-211ENST00000552643 TRIM41Q8WV44 630 aa41.82■■■■■ 4.29
CRIP2-211ENST00000552643 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.76■■■■■ 4.28
CRIP2-211ENST00000552643 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.71■■■■■ 4.27
CRIP2-211ENST00000552643 PBRM1Q86U86 1689 aa41.69■■■■■ 4.26
CRIP2-211ENST00000552643 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.67■■■■■ 4.26
CRIP2-211ENST00000552643 GRIN2BQ13224 1484 aa41.62■■■■■ 4.25
CRIP2-211ENST00000552643 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.57■■■■■ 4.24
CRIP2-211ENST00000552643 KIF27Q86VH2 1401 aa41.5■■■■■ 4.23
CRIP2-211ENST00000552643 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.45■■■■■ 4.23
CRIP2-211ENST00000552643 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
CRIP2-211ENST00000552643 CHD1O14646 1710 aa41.41■■■■■ 4.22
CRIP2-211ENST00000552643 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.41■■■■■ 4.22
CRIP2-211ENST00000552643 FBLN2P98095 1184 aa41.36■■■■■ 4.21
CRIP2-211ENST00000552643 ADAMTS12P58397 1594 aa41.34■■■■■ 4.21
CRIP2-211ENST00000552643 IGF1RP08069 1367 aa41.29■■■■■ 4.2
CRIP2-211ENST00000552643 SYNJ2O15056 1496 aa41.28■■■■■ 4.2
CRIP2-211ENST00000552643 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
CRIP2-211ENST00000552643 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.22■■■■■ 4.19
CRIP2-211ENST00000552643 CUL7Q14999 1698 aa41.17■■■■■ 4.18
CRIP2-211ENST00000552643 OSCARQ8IYS5 282 aa41.13■■■■■ 4.18
CRIP2-211ENST00000552643 GRIN2AQ12879 1464 aa41.1■■■■■ 4.17
CRIP2-211ENST00000552643 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
CRIP2-211ENST00000552643 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.07■■■■■ 4.16
CRIP2-211ENST00000552643 EEA1Q15075 1411 aa40.98■■■■■ 4.15
CRIP2-211ENST00000552643 CEP170Q5SW79 1584 aa40.95■■■■■ 4.15
CRIP2-211ENST00000552643 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.93■■■■■ 4.14
CRIP2-211ENST00000552643 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.92■■■■■ 4.14
CRIP2-211ENST00000552643 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.88■■■■■ 4.13
CRIP2-211ENST00000552643 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.87■■■■■ 4.13
CRIP2-211ENST00000552643 NUP160Q12769 1436 aa40.87■■■■■ 4.13
CRIP2-211ENST00000552643 PRXQ9BXM0 1461 aa40.85■■■■■ 4.13
CRIP2-211ENST00000552643 KIF21BO75037 1637 aa40.63■■■■■ 4.09
CRIP2-211ENST00000552643 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.62■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms