Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRGC1P0CF51 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRGC1P0CF51 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms