Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC38Q502W7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms