Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA3P35244 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA3P35244 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPA3P35244 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPA3P35244 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPA3P35244 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPA3P35244 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPA3P35244 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms